Среднее течение считается от Вены до ущелья, носящее название Железные Ворота. На этом участке русло проходит по Среднедунайской равнине. Речная долина широкая и варьируется в пределах от 5 до 20 км. Русло довольно извилистое и разветвлённое. Скорость течения составляет 0,7-1,1 м/сек. Местами водный поток пробивается через хребты и образует долины. В таких местах он сужается до 150 метров, а глубина возрастает до 20 метров. В ущелье Казане максимальная глубина доходит до 70 метров.
Нижнее течение пересекает Нижнедунайскую равнину. Считается оно от ущелья Железные ворота до устья. В этом месте река Дунай носит равнинный характер. Широкая пойменная долина, ширина которой доходит до 10-20 км, разветвляется на протоки и рукава. Ширина водного потока доходит до 2 км, глубина составляет 5-7 метров при скорости течения 1 м/сек.
Хозяйственное использование Дуная заключается в судоходстве. строительстве плотин для ГЭС и ирригации, сбросе промышленных вод, рыболовстве, лесосплаве и др.
