оплата уставного капитала ООО на момент регистрации общества?

Да, оплата таким образом уставного капитала ООО вполне допустима.
Однако странно что в указанном случае ООО вообще было зарегистрировано!
Согласно п. 2 ст. 16 Федерального закона от 8 февраля 1998 г. N 14-ФЗ "Об обществах с ограниченной ответственностью" на момент государственной регистрации общества его уставный капитал должен быть оплачен учредителями не менее чем наполовину. При этом, в соответствии с положениями статьи 12 Федерального закона от 8 августа 2001 г. N 129-ФЗ "О государственной регистрации юридических лиц и индивидуальных предпринимателей" при государственной регистрации создаваемого ООО в налоговую наряду с другими документами представляется подписанное заявителем заявление о государственной регистрации по форме, утвержденной уполномоченным Правительством Российской Федерации федеральным органом исполнительной власти, в котором кроме прочего подтверждается, что при создании юридического лица соблюден установленный для юридических лиц данной организационно-правовой формы порядок их учреждения, в том числе оплаты уставного капитала (уставного фонда, складочного капитала, паевых взносов) на момент государственной регистрации.
ООО может быть ликвидировано в случае допущенных при его создании нарушений закона, но только по решению суда и если эти нарушения являются грубыми и носят неустранимый характер (абз. 3 п. 2 ст. 61 ГК РФ, абз. 1 п. 1 ст. 57 Закона об ООО) .
Однако указанное в вопросе нарушение вряд ли можно назвать грубым и уж тем более носящим неустранимый характер.
В пункте 1 статьи 16 Закона об ООО например сказано, что каждый учредитель общества должен оплатить полностью свою долю в уставном капитале общества в течение срока, который определен договором об учреждении общества или в случае учреждения общества одним лицом решением об учреждении общества и не может превышать один год с момента государственной регистрации общества.
Таким образом, нарушение положений пункта 2 статьи 16 Закона об ООО, устанавливающих обязанность учредителей оплатить на момент государственной регистрации общества не менее половины его уставного капитала, не может служить основанием для ликвидации такого ООО.

Вносили деньги после регистрации ООО, открытия банковских счетов, получения ОКВЭДов и т. д.

Оооо сколько много написал Коала - славный малый! ) Не парься, я таких случаев не разу не слышал. По закону надо не менее 50% на момент регистрации оплачивать, а потом в тчение не более года оставшуюся часть.
Все нормальные людю оплачивают 100% после регистрации, особенно если суммы копеечные!