Проблема со вторым хардом...

Делай в БИОСе загрузочным диск 40 . Если все равно не грузит, то загрузись с установочного диска, выбери режим восстановления и введи команды : fixboot затем fixmbr далее exit, перезагрузка . Собственно он у тебя не может найти загрузочную запись . Этими командами восстанавливается загрузочный сектор и загрузочная запись.
При загрузке в режиме восстановления требует пароль администратора, если пароль не вводился - просто нажать ENTER

Акронисом клонировать MBR. Или переставляйте систему

у тебя на нем нет винды. переустанови или клонируй со второго диска.

Зайди в BIOS и установи HDD на 40 гигов первым загрузочным устройством ...

такие вещи экспериментальным путем определяются.

После смены конфигурации винчестеров в биосе надо выбирать Boot последовательность.
выбери сначала один винчестер загрузочным, потом другой, так или эдак должно получиться.
если пишет ntldr not found это скорее всего потому что пытаешься загрузиться не с того винчестера.

з. ы ещё такой эффект можно получить при попытке поставить XP поверх Висты.
потому что у этих систем разные MBR.
уродская виста всячески препятствует установке XP, поэтому если такая ситуация то придётся повозится с восстановлением MBR для XP

Загружаешься с диска Acronis Disk Director и проверяешь, с какого харда идет загрузка. Если с того, где стоит система - то этим же акронисом копируешь загрузочную запись с другого харда (см. пост выше)