По заявлению гражданки З. об изнасиловании ее гражданином Б. было возбуждено уголовное дело,

Поскольку дела об изнасилованиях относятся к делам частно-публичного обвинения, и не подлежат прекращению ни за примирением сторон, ни по другим основаниям, на мой взгляд, действия следователя были вполне законными и процессуально грамотными. Все следственные действия правильно проведены и закреплены. Желание и мнение потерпевшей в данном случае во внимание приниматься не должны. Если дело получит судебную перспективу и будет рассматриваться в судебном порядке, потерпевшая вправе заявить ходатайство о рассмотрении его в закрытом судебном заседании.

Согласно ст. 179 УПК РФ (смотрите ниже) отказаться от освидетельствования может только свидетель, да и то не всегда ( ч. 1 ст. 179 УПК РФ - за исключением случаев, когда освидетельствование необходимо для оценки достоверности его показаний) . Согласие же потерпевшего не требуется. Согласно ч. 2 указанной статьи - О производстве освидетельствования следователь выносит постановление, которое является ОБЯЗАТЕЛЬНЫМ для освидетельствуемого лица.
В ст. 42 УПК РФ (о потерпевшем, его правах и обязанностях) сказано, что в случае неявки без уважительной причины, он может быть доставлен принудительно. Требование по понятыи одного пола выполнено, следователь сам не участвовал, делал врач, а следователь уже потом зафиксировал результат. Даже указли что помимо воли провели.
Итог - все действия следователя законны и такое доказательсво будет допустимым.

Статья 179. Освидетельствование
1. Для обнаружения на теле человека особых примет, следов преступления,... может быть произведено освидетельствование подозреваемого, обвиняемого, потерпевшего, а также свидетеля с его согласия, за исключением случаев, когда освидетельствование необходимо для оценки достоверности его показаний. В случаях, не терпящих отлагательства, освидетельствование может быть произведено до возбуждения уголовного дела.
(в ред. Федерального закона от 02.12.2008 N 226-ФЗ)
2. О производстве освидетельствования следователь выносит постановление, которое является обязательным для освидетельствуемого лица.
3. Освидетельствование производится следователем. При необходимости следователь привлекает к участию в производстве освидетельствования врача или другого специалиста.
4. При освидетельствовании лица другого пола следователь не присутствует, если освидетельствование сопровождается обнажением данного лица. В этом случае освидетельствование производится врачом.
5. Фотографирование, видеозапись и киносъемка в случаях, предусмотренных частью четвертой настоящей статьи, проводятся с согласия освидетельствуемого лица.

она придурочная зачем заявление писала??!! все законно

Проводить исследования, экспертизы без желания лица-не имеет права, имеется ввиду, например, проведение судебно-мед. экспертизы (на предмет наличия телесных повреждений, факта половых сношений...). А досмотр лица в присутствии понятых одного пола с досматриваемым лицом, оформленый соответствующим протоколом-это законно, более того, проведено с соблюдением требованиям закона. очень странно, что потерпевшая, подав заявление о такого рода преступлении, т. е. обратившись за помощью в правоохранительные органы для установления и последующего наказания виновного лица, - не оказывает помощь следствию, а напротив пытается воспрепятствовать ему. она что оклеветала человека или примирилась с ним, считает это своим личным интимным делом??!! вот тут непонятно...