Предстоит рассмотрение дела в кассационной инстанции, сроки давностисти по делу уже истекли....

кассация будет рассмотрена в любом случае. сроки будут учтены при рассмотрении

Плохо поставлен вопрос, неграмотно. Если процессуальные сроки на подачу кассационной жалобы истекли это одно. Срок можно восстановить. Если истекли сроки давности на пересмотр решения, то это другое. Вы как задали вопрос так и получите на него ответ.

Прекращено с учетом действующего законодательства не может быть, если обвиняемый против этого возражает. В таком случае производство по уголовному делу продолжается в обычном порядке. Есть ли ходатайство подсудимого?

Срок давности привлечения к уголовной ответственности? Если это так, то тут много факторов, если за это время чловек скрывался от следствия или суда, то течение сроков даности не идет.
Если он не скрывался, то получается, что поскольку кассация не пройдена ( приговор не вступил в законную силу) . В этом случае, при наличии заявления подсудимого обвинительный приговор будет засилен и от наказания он будет освобожден. Собственно при условии, что приговор обвинительный уже постановлен, заявление подсудимоо не обязательно

Исковая давность в гражданском судопроизводстве и ваша ситуация-разные вещи) Приговор должен вступить в законную силу (законная сила-отсчитывайте 10 дней). Но раз Вы обжаловали, то Вам нужен дождаться решения Мосгорсуда в любом случае... А там сроки сильно растянуты

если сторона не заявит, судье то что

В уголовном праве срок давности начинает идти СО ДНЯ вступления в силу приговора! у вас он начнётся со дня кассационного определения - щас он ещё даже не наступил.
вы путаете с исковой давностью в гражданском праве где она начинает течь с момента нарушения прав!