Почему сгнили корешки рассады помидор? см.Ниже.

Прошедшей весной я привез пару мешков навоза (коровяк) и закопал в одном месте. Перед морозами я выкопал его оттуда, насыпал два ведра и оставил на зиму в ведрах. "Навоз" промерз хорошо. Ранней весной занес это добро в дом, перетер его хорошо, смешал еще с землей в пропорции 1:1 и оставил еще на месяц. Потом набрал в горшки и высадил семена помидор: в один горшок россыпью, а в другой акуратно, что бы не пикировать, на глубину около 0.5 см. Они довольно хорошо проросли. Те которые были посеяны россыпью рассадил (пикировал) их в обильно смоченный грунт на глубину около 2 см. Те которые пробились отдельно (очень хорошо), когда они выросли до 5 см, я засыпал сверху (еще около 3-х см) грунтом и обильно полил. Вся рассада довольно сильно заболела. Почти месяц стояла, и в лучшем случае вытянулась до 8 см. Вчера я ее решил из горшков просто "выбросить" в огород. Аккуратно вынул из горшков, опустил в землю, полил. А ради интереса выдергнул по одной "веточке" из двух разных горшков... Странное наблюдение: в обоих случаях отгнили корешки рассады (по пару ниточек осталось), и в то-же время, в обоих случаях не пошла корневая система выше, от стебля. ПОЧЕМУ?