Из-за чего у эхеверии появились такие пятна?

Скорее всего это признак водянки, проявляется при сочетании прохлады и переувлажнения грунта.
Вы не указали температуру содержания. А это очень важный фактор. Именно от температурного режима и зависит напрямую частота полива.
Вода должна быть теплой и отстоенной. Суккуленты очень болезненно реагируют на холодную, жесткую воду.
Допустимая t° содержания в зимнее время не выше 18°-20°. В идеале между 6°-15°(зависит от влажности в помещении).
Я содержу свои немногие суккуленты в отапливаемом подвале около окна. Температура держится в районе 8°-10°. Поливаю раз в месяц. Не переусердствую. Подкормки тоже не провожу до весны.
°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°°
Что Вы сейчас можете сделать, так это просушить полностью грунт и некоторое время не поливать. Держать подальше от отопительных приборов, организовать более прохладные условия с хорошим освещением (чтобы не допустить вытягивания побегов), исключить сквозняки. И вести наблюдение.
Об уходе и проблемах выращивания:
https://iplants.ru/echeveria.htm
Что еще немаловажно, так это и состав субстрата.
Когда было приобретено растение и проводилась ли пересадка?
Грунт необходимо использовать для суккулентных, т. е. содержать песок. Магазинные экземпляры "сидят" обычно в торфе с добавлением кокосовых волокон.
Дренажные отверстия, я полагаю, имеются.
http://happyflora.ru/view_post3.php?latter=390
Горшок, насколько позволяет судить фото, подобран правильно. Но я бы предпочла глиняный.

это от переувлажнения... полив возможно избыточный был... сократить полив и дать растению просохнуть... впредь поливать только по мере просыхания земли в горшке и полив должен быть ограниченным... для профилактики опрыснуть растение фитоспорином...

Цветок вообще до конца марта не поливать нужно! Он дрыхнуть сейчас должен.