Почему многие предпочитают ЯП C# нежели Javascript при разработки в Unity?

потому что многие вообще плюются от javascript (я, кстати, тоже не понимаю, как он может нравиться в чистом виде).
Плюсы и минусы искать достаточно сложно - потому что вообще это два совершенно различных языка, схожих между собой, например, как пароход и автомобиль - общее что-то вроде есть (наподобие возможности перевозки живности/вещей), но все равно это слишком разные вещи.
Шарп - понятный и относительно простой ЯП, привычный большинству по синтаксису. JavaScript совершенно другой, плюс порой взлетают костыли)

З. Ы. Это только мое мнение, возможно, кто-то имеет отличное..

Я подозреваю, что в Unity не используется обычный javascript. Разница в javascript и c# в варианте Unity минимальная - лишь в синтаксисе. Семантика, ООП языков идентична. То бишь разница лишь в том, как ты записываешь код. Поэтому большого значения не имеет, каким языком пользоваться. Но лично мне синтаксис c# нравится больше, да и он всегда был более популярным для программирования приложений, в то время как чистый javascript использовался для web (но в юнити не он).

C# придерживается класического C стиля и бурёт всё лучшее от ООП, javascript выгледит как один большой костыль когда на нём пишут что-то сложнее менюшечки

Это ИМХО, не бугурьте

C# - это официальный язык под .NET. юнити на платформе .NET. как следствие, и по IDE, и по инфе в инете все лучше у C#. вот главная причина