Автор текста вправе ставить знаки препинания где посчитает нужным, даже если оно противоречит правилам грамматики?

и ещё сам решает стоит ли использовать прописные буквы в начале предложения.

Только автор художественного произведения.

Может, но это должно свидетельствовать не о бытовой безграмотности автора, а - подчеркивать художественные образы, на чем-то заострять внимание. Пример - Улисс Джойса.

Это смотря по тому, что автор хочет сделать. Если донести свои мысли или чувства до читателя, то знаки препинания на то и существуют, что помогают это сделать. Если автор не владеет пунктуацией, то это плохой автор.
Если же автор хочет повыдрючиваться и изобразить что-нибудь эдакое, вроде "дыр бул щир", то, конечно, пусть ставит где хочет. Никто ведь в итоге никого не будет заставлять читать эту пургу насильно.

Корректор на то и существует, чтобы править текст. Уважающий свое издание редактор не позволит, чтобы текст изобиловал ошибками. Грамотному читателю они мешают вчитываться в текст.
Я помню, читала издания, где орфографические ошибки Солженицына не исправлялись, но делались сноски, пометки, что это написание автора. Не поняла, с какой целью. Возможно, хотели показать безграмотность автора, или преследовалась еще какая-то цель.
В настоящее время в переводах полно ошибок, очевидно, потому, что экономят на корректоре.

На всякого мудреца довольно простоты, однако! - Какой же редактор, если он уважает читателя и самого себя, не говоря о правилах правописания, пойдет "на поводу" у автора?! -Нет, уважаемый, писать "как хочется автору" - не получится, придется либо искать сговорчивого редактора, который закроет глаза на все ваши "желания", либо - подчиниться общепринятым нормам, чтобы в вашей книге НЕ БЫЛО никаких слов и даже букв, противоречащих "Правилам и нормам русского литературного языка" (собственно, они для того и созданы, чтобы их соблюдали!) имхо
---
*кстати, расстановка знаков препинания подчиняется правилам ПУНКТУАЦИИ, а правилам ГРАММАТИКИ - написание слов и букв!

Знаки препинания ( особенно ; и - куда ни шло), запятые безусловно нужно править. Но посмотрите, что творится с ТЬСЯ-ТСЯ. Полный ППЦ.

Запятые к грамматике не имеют никакого отношения. Можно их ставить после каждого слова, можно, как многие, не ставить вообще. Но не забывайте, что запятая, как и другие знаки препинания, подчиняющиеся правилам ПУНКТУАЦИИ, помогает организовывать текст, обозначает паузы в речи, придает дополнительный, а иногда и основной смысл любой фразе. "Казнить нельзя помиловать" - классика жанра, можно обойтись без запятой?

Терпеть не мог когда в школьных сочинениях мои запятые вычеркивали

Конечно, в праве. И пробел, кстати, тоже. Он ведь автор! А сейчас столько их развелось, что просто нужно как-то выделяться из серой массы. Почему бы не тугоумием?

Я, лично, когда читаю фанфики или произведения, безграмотно написанные, обращаю внимания, в первую очередь, на ошибки в словах, на несуразные сравнения, на банальные избитые словосочетания. На знаки препинания мало обращаю внимания, ну, только если они совсем тупо стоят и там, где явно стоять не должны. Но бывает, часто, у автора и слог отличный, и сюжет не подкачал, и умение подать материал присутствует, но на каждую страницу проскальзывает пара-тройка ошибок. Сижу - их исправляю, если публичная бета открыта. А если явная малолетка писала, пробуя себя, а помимо ошибок в тексте нет ни смысла, ни логики, лишь пафос - бросаю читать сие сомнительно чтиво.