Какой алгоритм или методику можно составить по выявлению рисков компании?

Стандартные методв лучше использовать, чтобы понимать, как использовать результаты такой оценки.
1. СВОТ-анализ.
2. Структурный анализ рынка.
3. Статистический анализ бухгалтерской отчетности.
4. Оценка квалификации персонала.
5. Оценка УКП.
6. АБЦ-анализ ассортимента.
7. АБЦ-анализ конрагентов.
В итоге - 80% ключевых рисков будет выявлено.
Неделя работы эксперта на любых входных данных.
Всеми абсолютно рисками стоит управлять. Рисков, не зависящих от компании, не бывает.

Мы на предприятии при планировании или составлении инвестиционных проектов делим риски на внешние и внутренние.
1)Внешние риски (не зависят от нас, мы на них повлият не может) подразделяются на группы: рынок, банки, инвесторы, клиенты, политика-экономика страны (для кого-то и это может быть) .
Например: проанализировав ситуацию в банковском секторы, вы предполагаете, что в будущем году ставки по кредитным линиям будут увеличены на ...% Как изменится бюджет компании, финансовые показатели, если банк поднимет ставки по кредитной линии? .
Или, как изменится деятельность вашей фирмы, если произойдут определенные события на рынке (допустим, появление на рынке крупного торговца, способного влиять на ценообразование в данном секторе экономики) ?
2)Также поступают и с внутренними рисками (т. е. теми рисками, которыми вы можите управлять и на которые можите воздействовать)

Риски можно рассматривать и по степени влияния на деятельность фирмы или на конечный финансовый результат.

В любом случае вы сначала выделяете факторы риска, степень их влияния, показываете варианты развития событий и мероприятия. (т. е. как вы намерены действовать, если события будут развиваться по одному из прогнозных сценариев)

Вопрос что за компания - производство, торговля, обслуживание, и. тд. Обычно на больших компаниях это делает аудит внутренний или даже по нескльким направлениям. На маленьких компаниях сами руководители или аудитор. Если надо и предприятие небольшое, тогда могу помочь.