За годы существования Харьковского метрополитена способы оплаты проезда менялись несколько раз. Была оплата советскими пятикопеечными монетами, жетонами различных цветов (например, оранжевого) , бумажными билетами с магнитной полосой, отрезными пластиковыми картами, контактными смарт-картами.
Цена проезда с 14 февраля 2009 года, согласно распоряжению главы Харьковской облгосадминистрации Арсена Авакова, составляет 1 гривну 50 копеек.
Проезд осуществляется с помощью прозрачных жетонов темно-зелёного и темно-голубого цветов. С июля 2007 года в качестве средства оплаты проезда внедрены RFID-карты с возможностью внесения на их счёт от 1 до 499 грн. Студенты имеют право на скидку 50 % от стоимости проезда при использовании RFID-карты. Стоимость карты носителя составляет 7 грн. (с октября 2008, до этого — 5 грн. 50 коп.) . Тем не менее, количество льготных поездок ограничено 70 в месяц. Остальные поездки студентам приходится оплачивать по полной стоимости. Пополнить карту можно в специальных автоматах.
С октября 2009 года льготная категория пассажиров имеет возможность получить бесконтактную льготную карту для прохода через любой турникет на станции, что снижает нагрузку на служебный проход. По правилам использования эту социальную карту запрещено передавать третьим лицам.
С конца 2009 года в городе отказались от кассового метода продажи жетонов пассажирам, установив на станциях автоматы по продаже жетонов. Также перед входами в метро были установлены терминалы для смарт-карт. Сами смарт-карты продаются также специальными автоматами на некоторых станциях.

Жетон для прохода в метрополитен Харькова