С москвы на поезде до Кыштыма (Челябинская область) ближе через Екатеринбург или через Челябинск?

Ближе ч/з Екатеринбург, но не всегда быстрее. Прямой поезд ч/з Кыштым идёт только с Петербурга (№ 40 СПб-Астана), а со стороны Челябинска из Самары (Баку-Самара-Тюмень; №374)Так что пересадка-в любом случае и, возможно, не одна. Самые простые варианты: 1)
поездом (пачка поездов из МСК) до Екатеринбурга, далее на пригородном поезде до Верхнего Уфалея, (но лучше в Екб приехать утром, т. к пригородных всего 2( и на вечернем из них ехать-будет ночёвка в В. Уфалее) ждать около часа, идёт другой пригородный до Челябинска через Кыштым
2)До Челябинска на поезде, затем на пригородном (Челябинск-Кыштым-В. Уфалей, 2 шт) до Кыштыма, или на автобусе (больше 10 рейсов в день) .
По времени варианты примерно одинаковы за счёт того что Москва-Челябинск больше на пару сотен км в сравнении с самым длинным маршрутом Москва-Екатеринбург (ч/з Ярославль) и больше на 400 с лишним км с самым коротким (ч/з Казань), но может быть компенсировано более частым курсированием автобусов со стороны Челябинска
Варианты пересадки напр по Кирову (или другой крупной ст) на прямой поезд до Кыштыма (см. выше) малопривлекателен из-за : №40 идёт не каждый день; почти всегда забит до отказа-народ в Казахстан едет и много. .
вообще маршруты между оживлёнными направлениями по малодеятельным участкам, таким как Екатеринбург-В. Уфалей-Челябинск всегда осложнены очень малым количеством поездов и довольно вялой ездой по скорости (а чего взять с неэлектрифицированной однопутки...), и будь Кыштым на магистральном ходу, добраться было б в разы проще и намного быстрее. Удачи!