Кладовая генома человека. Какие тайны скрывает в себе мусорная ДНК?

Она не мусорная, а скорее не кодирующая ДНК. И её даже не 95%, а больше (если мы говорим о человеческом геноме) . И это не просто один "тип" ДНК, а совершенно разные.
Начиная от многочисленных повторов, транспозонов, интронов, регуляторных элементов и заканчивая теломерами. И функции их различны и очень важны и все разом не описать. Многие очень специфичны, многие ещё не известны.
Основные, как правильно замечено выше - это регуляция генов, они обеспечивают правильное считывание генетической информации, обеспечивают место для посадки ферментов, отвечающих за репликацию ДНК, сплайсинг, экспресиию генов и прочее и прочее. Иными словами, эти некодирующие последовательности ОБЕСПЕЧИВАЮТ ПРАВИЛЬНУЮ РАБОТУ ГЕНОВ.
А о важности функций теломер можно и не рассказывать - они располагаются на концах хромосом и защищают их. Эти теломерные участки уменьшаются с каждым делением клетки и именно с этим связывают процессы старения, так что важность теломер трудно переоценить.
Что касается эволюционной роли, то например, псевдогены с большей скоростью накапливают мутации, и соответственно быстрее могут выработать новые функции, которые, если окажутся полезными, будут поддерживаться естесственным отбором. Таким образом, можно сказать, что это некие "предшественники" генов, которые в случае могут начать работать и стать "настоящими" генами.
Т. е. эволюционная роль некод. ДНК - это запас материала, так сказать - некий пластелин, из которого эволюция может вылепить нужное, если понадобится.

может там и хранится что-то нужное, ведь никому не известно, человек -загадочное существо)

На эту тему море литературы. Не мусорная она. Если коротко - играет важнейшую роль в регуляции генов и прогрессивной эволюции.

А транспозоны кодируют белки, нужные для собственного перемещения.

Это можно проверить с помощью генной инженерии и вывести человека у которого удален этот мусор.