Почему даже спустя миллионы лет империум отстаёт очень сильно от некронов?

О каких миллионах лет идет речь? Империуму примерно 12к лет и он давно впал в эпоху технологического регресса, т. е. то, что во время Императора было в порядке вещей, сейчас позабыто. Космические корабли современного Империума в целом уступают своим более ранним аналогам, многие образцы техники являются реликтами, ну и так далее.

Некроны ни какими исследованиями не занимаются, они в свое время из зависти к Древним заключили союз с К'танами (полубожественными существами, живущими внутри звезд и питающимися их энергией), но вместо этого потеряли свои души, превратившись в эдаких высокотехнологичных зомби. В седьмой редакции это исправили - последние К'таны погибли и некроны обрели самостоятельность (даже наладили отношения с Империей Тау). С восьмой редакцией я не знаком, но как раз одним и главным моментов завязки сюжета для перехода к ней стало то, что некрон "помог" Империума отстоять Кадию, что привело к её уничтожению (то ли некрон специально, то ли сама технология подвела). Тиранидам нет особо дела до некронов - им нужна органика, некроны раньше с ними сражались, только если тираниды случайно напарывались на их гробницы.
Собственно мне кажется, что наиболее сильное положение сейчас у Тау, пусть они и отбиваются от тиранидов. Империум в целом тоже укрепился: эльдары вроде избавились от Слаанеша, пожиравшего их души, создали нового бога (правда Караул Смерти сорвал завершение ритуала и тот получился не таки сильным, каким планировался), который помог вернуть к жизни Жилимана. Собственно у Империума теперь есть примарх (может скоро их будет больше, есть надежда, что исцелится Лев, вернутся Хан и Русс), правда они потеряли Кадию и теперь Хаос может наступать по всем фронтам..., но тут нужно подождать выхода новых книг.