на флешке есть папки, но их не видно! с помощью каких программ можно их посмотреть?

Откройте флешку через любой архиватор или Тотал Коммандер.

установить отображение скрытых файлов и папок в проводнике

fast stone image viewer.

Через архиватор ???А почему не через Автокад ?
2 Доу - ты вопрос читал ?
Ответ: Тотал Командером, с включенным отображением скрытых файлов.. . Им же потом можешь изменить атрибуты файлов на более видимые -))
И еще - никогда в жизни не пользуйтесь стандартным виндовым Проводником - у него вредная привычка выполнять автоматически автораны и так же автоматически заражать систему...

было такое, вирус с виндового компа попал на флешку, создал ярлыки с названием папок и папку RECYCLER с вирусом, на который они указывали.... С винды папок не было видно (отображение скрытых стояло).. В Линуксе все папки были видны, там удалил ярлыки и вирус, скопировал папки, отформатировал флешку, вернул папки на место...

Как выше написали челы:
Папка-сервис-параметр папки-вид-показывать скрытые файлы, папки. диски.
Если желаешь восстановить, то, что было на флехе, диске после деинсталляции вот тебе прога и флаг в руки.
R-Studio - лучшее на сегодняшний день программное обеспечение для восстановления данных. Поддерживает файловые системы FAT12/16/32, NTFS, NTFS5, Ext2FS (Linux). Позволяет восстанавливать файлы, как на локальных логических и физических жестких дисках, так и на дисках, расположенных на удаленных компьютерах через компьютерную сеть.

Можешь взять здесь:
http://www.cwer.ru/sphinx/?s=R-Studio

"Отображение скрытых файлов" включи.

Включи показ скрытых папок и файлов в проводнике Сервис, вкладка параметры папок.