Недавно один из пользователь нашего проекта написал мне, что ярлыки на рабочем столе - это вред и зло.

Отдельный диск под систему и подход "перестрахуюсь, лишь бы что-нибудь не сломалось" был актуален лет 10 назад, во времена windows xp и ранее. Некоторым и 20 лет стажа не хватает, чтобы переучиться.
Не обращайте внимания, работайте как вам самой удобнее.

чарли прав, перенеси рабочий стол на Д и засирай его как хочешь

Про сохранение на диск Д - да, конечно. Если навернется система и придётся её переустанавливать - то они будут потеряны, если были на С. А обилие значков на рабочем столе - в НЕКОТОРОЙ степени нагружает оперативу. При нынешних компах это несущественно

Проблема актуальна на Windows, тянется с версий 2000 и новее (не знаю как там у вин 8 с этим). Быстродействие на слабых машинах заметно зависит от кол-ва ярлыков на рабочем столе. На хорошем железе разница незаметна.

Насчет хранения данных на нем - есть такая формулировка:
Система должна располагаться на диске C:\ а данные на других разделах - это исключает приличную часть ошибок записи на системном разделе и уменьшает шансы сломать ФС. В конторах переносят папку Мои документы и Рабочий стол на диск D:\ (распространенная практика), и тогда на рабочем столе можно спокойно хранить что угодно и сколько угодно.

Это верно на 100%.

это так, заверши процесс explorer.exe и раб. стол будет чист и комп будет работать быстрее.

на счет диска D - есть это второй hard disk - это в тройне удобнее и твои файлы и в правду будут в безопасности от подобного рода проблем.

рабочий стол равно как и корзина это диск С-делай вывод

Не правильно говорит. Именно ярлыки папок и файлов - можно и нужно держать на рабочем столе. НО НЕ САМИ ПАПКИ И ФАЙЛЫ! Вот их-то надо держать на другом логическом/физическом диске. Если система навернётся, пропадут только ярлыки, а файлы останутся на другом диске.