В автозагрузке C:\WINDOWS\system32\ctfmon.exe и C:\WINDOWS\system32\NvCpl.dll. Какие функции этих файлов?

ctfmon.exe - это то, что у вас переключает язык с русского на английский и обратно. А второе относится к видеокарте. Первое из автозагрузки убирать нельзя, а второе - можно.

Stfmon это Языковая панель. А NvCpl.dll это один из компонентов Центра управления виджеокартой GeForce

ctfmon.exe - microsoft'овская приблудина, компонент ms office (обещают, что пропадет после деинсталляции alternative user input), руками вычищать бесполезно
NvCpl.dll - запускалка контрольной панели nvidia, на фиг не нужна, можно выносить (однако тоже имеет свойство без спросу ставиться обратно)

Если сомневаетесь что грузиться что-то подозрительное, рекомендую программу AnVir ;)

А про те 2 программы, написано верно!
Есть разные приблуды обычно и от звука ;)
-----------------
Вот что можно оставлять:
NvCpl
Nwiz
NvMcTray
RTHDCPL
ALCMTR
ctfmon
----------------
Есть еще Ati*** (Но это не ваш вариант у вас Nvideo GeForce)
soundman - Можно выключить (Он искажает звук (типа звук как из трубы :) абсолютно не нужная вещь в 99,999% случаев ))

Ctfmon.exe управляет технологиями альтернативного ввода данных. Он запускает языковую панель в системной трее при старте операционной системы, и работает в фоновом режиме даже после закрытия всех программ пакета Microsoft Office, независимо от того, запускались ли программы Office XP.

Программа Ctfmon.exe активирует процессор текстового ввода компонента «Альтернативный ввод данных» и языковую панель Microsoft Office. Программа производит мониторинг активных окон и предоставляет поддержку клавиатуры, перевода, распознавания речи и рукописных символов, а также других технологий альтернативного ввода данных. Удалять Ctfmon.exe не рекомендуется, потому что это может вызвать проблемы в работе программ пакета Microsoft Office.

Файл Ctfmon.exe всегда расположен в C:\Windows\System32. В случае обнаружения этого файла в любом другом каталоге он должен быть незамедлительно удален. В настоящее время известно множество вирусов (например W32.Snow.A, Spyware.UltraKeylogger, Trojan.Satiloler и другие) , использующих имя Ctfmon.exe для сокрытия своего присутствия в системе. NvCpl.dll :он отвечает за языковую панель

Ctfmon.exe управляет технологиями альтернативного ввода данных. Он запускает языковую панель в системной трее при старте операционной системы, и работает в фоновом режиме даже после закрытия всех программ пакета Microsoft Office, независимо от того, запускались ли программы Office XP.

Программа Ctfmon.exe активирует процессор текстового ввода компонента «Альтернативный ввод данных» и языковую панель Microsoft Office. Программа производит мониторинг активных окон и предоставляет поддержку клавиатуры, перевода, распознавания речи и рукописных символов, а также других технологий альтернативного ввода данных. Удалять Ctfmon.exe не рекомендуется, потому что это может вызвать проблемы в работе программ пакета Microsoft Office.

Что такое файл Ctfmon.exe?
Файл Ctfmon.exe активирует процессор ввода данных TIP "Альтернативный ввод данных" и языковую панель Microsoft Office.

Какие функции выполняет файл Ctfmon.exe?

Ctfmon.exe отслеживает активные окна и предоставляет поддержку службе ввода текста в отношении распознавания речи, распознавания рукописного ввода, ввода с клавиатуры, перевода и других технологий альтернативного ввода данных.
Можно ли удалить файл Ctfmon.exe?

Удаление файла Ctfmon.exe может привести к проблемам при использовании программ Office XP, так что удаление данного файла не рекомендуется. Чтобы предотвратить запуск Ctfmon.exe, выполните указанные ниже действия.

http://virtmachine.ru/ctfmon-exe-chto-eto-za-protsess.html

Говорили тут уже, используй windowsfix.ru