Посоветуйте программу для смены аудиодорожек на AVI, MKV видео и для добавления/удаления субтитров

ну например Avidemux — свободное кроссплатформенное приложение с открытыми исходными кодами, предоставляющее возможности для быстрого (и несложного) редактирования видеофайлов (удаления ненужных частей, наложения всевозможных фильтров и последующего кодирования). Поддерживается работа с различными типами видео (среди которых AVI, MPEG, MP4/MOV, OGM, ASF/WMV, VOB, MKV и FLV), имеется богатый набор фильтров. Avidemux работает с кодеками x264, Xvid, LAME, TwoLAME, Aften и другими [2][3][4][5].
http://avidemux.sourceforge.net/

это 2 отдельных программы нужно ставить.
1 Формат фактори - он конвертирует форматы
2 Мовави - простенький видеоредактор, в нем помоему есть субтитры

Virtualdub

Sony Vegas Pro
___________________
Возможности Sony Vegas Pro
Видео монтаж контента в реальном времени;
Профессиональная программа Sony Vegas Pro, обеспечивает качественную запись дисков;
Установка обновлений с официального сайта разработчика;
Можно создавать и редактировать красочную объемную анимацию в 3D;
Способность многодорожечной записи в высоком качестве HD или обычном SD;
Возможность редактирования, монтажа и изменения видео с камер сразу нескольких устройств;
При обработке аудио потоков, высокие характеристики обработки звука;
Поддерживается редактирование видео оптимизированного под параметры определенного устройства;
Актуальная версия программы, производить запись дисков Blu-ray Disc, а также DVD;
Софт поддерживает управление перетаскиванием (drag n drop);
Загрузить версию Sony Vegas Pro для Microsoft Windows, можно бесплатно;
Встроенные кроссфейды, спецэффекты настраиваются или применяются в автоматическом режиме;
Способность работы в режиме полного отсутствия окружающего звука, а также полноценная интеграция с аудиофайлами, субтитрами;
Поддерживаются разные источники исходного контента: диски, видеокамера, файлы, захват потока, экрана.
https://pcprogs.net/35-sony-vegas-pro-17.html