Стальной Алхимик 2003г и Сальной Алхимик: Братство 2009г

Fullmetal Alchemist и Fullmetal Alchemist: Brotherhood - две экранизации одной и той же манги. Ни в коем случае не отдельные сезоны.
Fullmetal Alchemist 2003 сперва следует сюжету манги, а концовка снята по оригинальному сценарию. В аниме экранизировано всего 7 томов манги. У этого аниме есть что-то вроде продолжения, фильм Fullmetal Alchemist: Conqueror of Shamballa (тоже снят по оригинальному сценарию).
Fullmetal Alchemist: Brotherhood 2009 полностью снято по манге, не отступает от неё. Аниме полностью закончено, история рассказана до конца. Экранизированы все 27 томов манги. После этого сериала можно посмотреть фильм Fullmetal Alchemist: The Sacred Star of Milos (дополнительная история снятая по оригинальному сценарию).
Оба аниме имеют свою атмосферу. В чем-то схожи, особенно первые серий 9, но постепенно обретают кардинальные отличия. Одни и те же персонажи вводятся в разных сериях, сюжет идёт иначе...
Первая экранизация показалась мне чуть мягче, чем вторая. Вторая больше держит в напряжении, в ней больше экшена, больше персонажей.
Но замечаю, что много людей думают иначе, больше склоняясь к первой экранизации.
Как смотреть вам? За вас мы, ответчики, решения не принимаем. Восприятие каждого индивидуально. Так что как смотреть - решать вам и только вам.

Ну тебе виднее, а так обе версии по своему великолепны.

ФМА братство, это не 2 сезон, а перезапуск. Многим, он нравиться намного больше, чем 1 часть. Только не забудь потом глянуть Четырёхпанельный театр / Fullmetal Alchemist: Brotherhood - 4-Koma Theater.