Законно ли взимание экологического сбора?

Абсолютно законно. Я просто не могу дать вам ссылку на закон посокольку не знаю территории на которой вы попались. Местные региональные службы имеют свою нормативную базу кроме федеральной

В соответствии с п. 4.4.4. Посещение посетителями музеев природы осуществляется за плату или бесплатно, в порядке, определяемом руководителями заповедников в соответствии с действующим законодательством Российской Федерации <ПИСЬМО> Госкомэкологии РФ от 04.08.1999 N 01-21/24-210
"О РЕКОМЕНДАЦИЯХ ПО ОРГАНИЗАЦИИ И ВЕДЕНИЮ ЭКОЛОГО-ПРОСВЕТИТЕЛЬСКОЙ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ В ГОСЗАПОВЕДНИКАХ"
Только это не является экологическим сбором! Эти платежи идут непосредственно в собственность заповедника, а не в бюджет государства

О том, кто и за что должен платить экологический сбор
Следует отметить, что формально обязанность вносить плату может появиться у любой организации, вне зависимости от того, насколько существенно ее влияние на экологию — будь то производство токсичных веществ или же обычное использование автотранспорта и т. д.

В соответствии с природоохранным законодательством РФ предприятия, учреждения, организации, иностранные юридические и физические лица, осуществляющие любые виды деятельности на территории РФ, связанные с природопользованием, именуются природопользователями. Такие вопросы как плата за загрязнение окружающей природной среды, размещение отходов и другие виды вредного воздействия, регламентируются Порядком, который утвержден постановлением Правительства РФ от 28 августа 1992 г. № 632 (далее — Порядок) . Он предусматривает взимание платы за следующие виды вредного воздействия на окружающую природную среду:

выброс в атмосферу загрязняющих веществ от стационарных и передвижных источников;
сброс загрязняющих веществ в поверхностные и подземные водные объекты;
размещение отходов;
другие виды вредного воздействия (шум, вибрация, электромагнитные и радиационные воздействия и т. п.) .
Важно отметить, что данный перечень является открытым.

Порядок предусматривает возможность уплачивать экологический сбор как в пределах допустимых нормативов, определенных законом, так и в пределах установленных лимитов, представляющих собой временно согласованные с Ростехнадзором нормативы.

В настоящее время указанная плата производится по утвержденной Приказом Ростехнадзора от 5 апреля 2007 г. № 204 форме расчета, и природопользователь обязан предоставлять его в территориальный орган Ростехнадзора ежеквартально. Но для этого прежде всего необходимо встать на учет в территориальном органе Ростехнадзора в качестве плательщика по каждому объекту негативного воздействия на окружающую среду — как передвижному, так и стационарному.