Скажите,если программы с диска С скопировать на диск D и удалить с С-работе программ не повредит?

Лично я делаю так. На диске С держу только систему и самые необходимые для работы программы - драйвера, браузер Опера, Офис, и средство разработки Visual Studio (я программист, и я с ним работаю) . Ну и те, которые без спроса ставятся на С. А на диске D находятся все остальные программы - утилиты всякие, игры и прочее.
Практика показывает, что как раз утилиты обычно работают с любого диска, некоторые даже без инсталляции - переписал программу из архива в папку Program Files, кинул ярлык на Рабочий стол, и готово.
А при крахе системы форматируется диск С, система ставится по новой, а остальное просто беру с диска D.
А вот драйвера и Офис просто так в новой системе не заработают, так что их лучше на С оставлять и вместе с системой ставить по новой.

Именно перемещать не лучший выход многие проги прописывают ключи в реестре и всякие файлы в скрытых папках которые находятся именно на диске С, просто при установке их надо ставить на С, НО не все проги будут спрашивать КУДА их ставить, они ставятся ТОЛЬКО на диск С (системный)

Вы просто НЕ СМОЖЕТЕ скопировать проги с С на Д - как вы вынете соответствующие записи из реестра, например?

при копировании вы копируете и пути обращений - т. е. к С, предположим, вы запускаете программу, а она ругается, что не может работать, т. к. пути обращений прописаны на С, а там ничего нет.. . резюме: скопировать-то можно, но работать не будет 95% программ...

смотря какие программы, но нежелательно. лучше сразу ставить на D

Можно, но потом они станут не корректно работать. . лучше переустановите на D и всё будет хорошо

смотря какая программа.
но точнее сказать, скорее всего не будет