Нужна помощь с редактированием текста

Элементарно. Делов на секунд 20-30. В Ворде есть ф-ция автозамены с огромными возможностями.

доменных зон не так уж и много а разобрать файл в последовательность и склеить со строкой на винде думаю невозможно но в программирование разделе уточните там точно скажут.

В индизайне я делаю так с помощью найти и заменить. Замена проходит в автоматическом режиме (можно и в полуавтоматическом, это когда каждая замена показывается визуально) . Говорят и в ворде что то похожее есть.

В Ворде лучше не автозаменой пользоваться, а соорудить Макрос.
Это нетрудно, писать ничего не придётся.
Войдите в меню Макросы.
Создать, имя дайте какое-то.
"Запись"
нажмите кнопки

End
/index.php
Home
стрелка вниз

"Записать"
И выведите на панель имя макроса -
Настройки - Макросы - перетащите значок с именем макроса на панель
Нажмите сколько надо.

Или создайте Макрос2, который раз 10-50 вызывает Макрос1, и его запустите в автомате.

Написать простую программу на с++. Считать построчно, к каждой строке добавить /index.php, записать в файл.
Или открыть с помощью блокнота, там есть функция Найти и Заменить все, так быстрее будет)

Как вариант.
Ставишь Sublime Text 2. Открываешь в нем файл, потом ставишь курсор куда надо. То же самое делаешь для других адресов, но с нажатым Ctrl и нажимая среднюю кнопку мыши. Будет мульти-добавление. Печатаешь, что надо. В нотепаде++ такая фишка тоже вроде есть. Посмотри в настройках, ее там включить надо.