задачка на c++

А почему в условии N до 250, а у вас размерность всех массивов только до 113?
Полагаю, ваше решение и идея этого решения изначально неверны. Значит искать и исправлять в нем ошибки бесполезно.
Рекурсивная функция должна подсчитывать минимальные суммы, а у вас она занимается какой-то фигней.

#include <fstream>
#include <iostream>
#include <algorithm>
using namespace std;

#define N 250

int t[N][N], s[N][N], p[N][N], n;

int f(int i = 0, int j = 0) {
if (s[i][j] == -1) {
if (i == n - 1 && j == n - 1) return s[i][j] = t[i][j];
else if (i == n - 1) return s[i][j] = t[i][j] + f(i, j + 1);
else if (j == n - 1) return s[i][j] = t[i][j] + f(i + 1, j);
else return s[i][j] = t[i][j] + min(f(i, j + 1), f(i + 1, j));
}
return s[i][j];
}

int main() {
int i, j;
ifstream in("input.txt");
in >> n;
for (i = 0; i < n; ++i) {
for (j = 0; j < n; ++j) {
char c; in >> c;
t[i][j] = c - '0';
}
}
fill(&s[0][0], &s[0][0] + sizeof(s) / sizeof(s[0][0]), -1);
f();
for (i = j = 0; i < n && j < n; ) {
p[i][j] = 1;
if (i == n - 1) ++j;
else if (j == n - 1) ++i;
else if (s[i][j + 1] < s[i + 1][j]) ++j;
else ++i;
}
ofstream out("output.txt");
for (i = 0; i < n; ++i) {
for (j = 0; j < n; ++j) out << (p[i][j] ? '#' : '.');
out << endl;
}
}

попробуйте без рекурсии, ведь есть множество замечательных алгоритмов нахождения кратчайшего пути (в вашем случае это минимальная сумма) http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%97%D0%B0%D0%B4%D0%B0%D1%87%D0%B0_%D0%BE_%D0%BA%D1%80%D0%B0%D1%82%D1%87%D0%B0%D0%B9%D1%88%D0%B5%D0%BC_%D0%BF%D1%83%D1%82%D0%B8