С++. Как сделать, чтобы значение массива, созданного в структуре изменялось в другой процедуре?

Процедуры -> Функции.
Здесь я предложу использовать функции внутри структуры. То есть они станут методами в частности нестатическими, то есть исполняемые для конкретного экземпляра. Заполнение осуществляется через конструктор, который вызывает метод. Вывод на экран происходит при вызове метода вывода, объявленного в теле структуры, из экземпляра.
Ссылки, указатели не нужны в данном случае.
Эти функции обслуживают экземпляры структуры, по - этому они должны быть методами и находиться в теле структуры с точки зрения эстетики.
Если что не понятно - спрашивай, объясню.

#include < iostream >
#include < iomanip >

using namespace std;

struct Myset //Создаем структуру Myset, которая будет играть роль множества
{
int Arr[256]; //Поле структуры

Myset() //Нулевой конструктор
{
Init();
}

void Init() //Метод заполнения поля Arr
{
for (unsigned i = 0; i < 256; i++)
{
Arr[i] = i;
}
}

void Output() //Метод отображения значения поля Arr
{
for (unsigned i = 0; i < 256; i++)
{
cout << setw(4) << Arr[i];
}
}
};

void main()
{
setlocale(LC_ALL, "rus");
system("color 0A");
Myset *ms = new Myset(); //Объявление экземпляра структуры и инициализация его посредством нулевого конструктора Myset()
ms->Output(); //Вызов метода отображения из экземпляра - метод не статический
cin.get(); cin.get();
}

Надо передать указатель или ссылку на структуры из одной функции в другую. Или использовать глобальную переменную. У тебя в каждой функции свой экземпляр структуры. Во второй функции массив не инициализирован, потому выводится мусор.