Книгу принято разделять на несколько частей: «ботаническая» — с рисунками растений, в большинстве своем неизвестных науке; «астрономическая» , проиллюстрированная изображениями Солнца, Луны, звезд и знаков Зодиака; «биологическая» , в которой собраны рисунки обнаженных женщин, находящихся внутри странных сосудов, заполненных жидкостью; «космологическая» , с круговыми рисунками непонятного содержания; и «фармацевтическая» , с нарисованными емкостями, около которых находятся рисунки различных растений и краткий текст, предположительно рецепты. Согласно рассказу самого Вилфрида Михаила Войнича, он приобрел этот манускрипт в 1912 году в одном из иезуитских владений к югу от Рима. Иезуиты решили продали Войничу несколько томов с твердым условием никому и никогда не разглашать имени продавца. Это обещание Войнич не нарушил до самой смерти. К книге прилагалось старинное письмо, датированное 1666 годом, которое написал ректор Пражского университета Иоганн Марци своему другу — известному средневековому ученому Атанасиусу Кирхеру, жившему тогда в Риме. Ректор просил Кирхера расшифровать эту книгу, которая, по его мнению, когда-то принадлежала королю династии Габсбургов Рудольфу II, который, в свою очередь, считал, что она написана Роджером Бэконом.
Существует четыре официальные гипотезы о манускрипте.
Версия 1.Текст написан на латыни, а ключ содержится на последней странице в надписи Michiton oladabas multos te tccr cerc portas. Если выкинуть оттуда «ненужные» символы, а буквы «o» заменить на «a», то получится Michi dabas multas portas. Что в переводе означает: «Ты дал мне много дверей» . А вот «двери» — это обозначение сочетаний двух букв на иврите в учении Каббалы.
Версия 2. Криптолог Жак Ги обнаружил, что язык текста Войнича по своей структуре очень похож на китайский или вьетнамские языки. В пользу этой теории говорит тот факт, что на некоторых рисунках изображены растения, произраставшие в то время только в Китае. Например, женьшень.
А вот исследователь из Болгарии Лео Левитов считает, что текст написан на искаженном фламандском языке. И речь там идет о ритуале «эндура» религиозного движения катаров.
Версия 3.Манускрипт содержит в себе два текста, написанных двумя разными почерками и на двух разных языках путём наложения знаков. Автор этой гипотезы профессор Рене Цандберген. Правда, и оба эти языка науке тоже неизвестны.
Версия 4. Манускрипт — это мистификация, — считает профессор Рене Цандберген. — Возможно, что он был написан человеком со странным складом ума, без намерения кого-то обмануть. манускрипт мог быть написан алхимиками специально для продажи королю Рудольфу II, который отличался тягой к оккультным наукам. Есть свидетельства, что за одну из старинных книг король отдал 600 дукатов, то есть около 3,5 килограмма золота.
Самое интересное то, что оказалось, текст «манускрипта Войнича» подчиняется закону Зипфа ( он эмпирически установил статистические закономерности распределения частоты слов) .
