Если ребенок - гражданин РФ, то для выезда из РФ согласие второго родителя не нужно, что достаточно убедительно разъясняет пограничная служба ФСБ РФ, сотрудники которой контролируют пропуск физических лиц через границу РФ, и в письмах, и на своем официальном сайте.
http://ps.fsb.ru/faq.htm

(2) Для оформления визы для въезда в страны Шенгена консульства стран Шенгена обычно требуют нотариально заверенное согласие второго родителя. Смотрите требования конкретной страны, они различаются. Собственно для пересечения границы при въезде в страны Шенгена такое согласие не требуется.
(3) Право гражданина РФ на въезд в РФ безусловно, его не имеют права не пустить в РФ.
Условиями может быть ограничено лишь право гражданина РФ на выезд из РФ.
Это прямо указано в ФЗ "О порядке выезда из РФ и въезда в РФ"