Штамп в свидетельстве о рождении ребенку

Вопрос регламентируется Приказом ФМС от 19 марта 2008 г. №64 "Об утверждении Административного регламента исполнения Федеральной миграционной службой государственной функции по осуществлению полномочий в сфере реализации законодательства о гражданстве Российской Федерации"
(скачать его и посмотреть можете, например, здесь
http://ufms.tomsk.gov.ru/html/norm-dok.htm

И там расписаны различные действия в зависимости от того, на основании какого пункта ФЗ "О гражданстве РФ" ребенок приобрел гражданство. Т. е. смотрите сам ФЗ "О гражданстве РФ" -ссылка на него на той же странице вверху
Статья 12. Приобретение гражданства Российской Федерации по рождению
1. Ребенок приобретает гражданство Российской Федерации по рождению, если на день рождения ребенка:
а) оба его родителя или единственный его родитель имеют гражданство Российской Федерации (независимо от места рождения ребенка) ;
б) один из его родителей имеет гражданство Российской Федерации, а другой родитель является лицом без гражданства, или признан безвестно отсутствующим, или место его нахождения неизвестно (независимо от места рождения ребенка) ;
в) один из его родителей имеет гражданство Российской Федерации, а другой родитель является иностранным гражданином, при условии, что ребенок родился на территории Российской Федерации либо если в ином случае он станет лицом без гражданства;
г) оба его родителя или единственный его родитель, проживающие на территории Российской Федерации, являются иностранными гражданами или лицами без гражданства, при условии, что ребенок родился на территории Российской Федерации, а государство, гражданами которого являются его родители или единственный его родитель, не предоставляет ребенку свое гражданство.
=======
У Вас, по сказанному Вами. оба родителя НА ДЕНЬ РОЖДЕНИЯ РЕБЕНКА являлись гражданами РФ (именно - не сейчас, а на день рождения ребенка) .
Тогда у Вас основание п. а ч. 1 ст. 12 ФЗ "О гражданстве" - поэтому смотрите Адм. регламент -
Удостоверение наличия у ребенка гражданства Российской
Федерации (пункты "а", "б", "в" части первой статьи 12,
части 2, 4 статьи 26 Федерального закона)

21. Данная функция исполняется по устной просьбе родителя (родителей) или законного представителя ребенка в возрасте до 14 лет, приобретшего гражданство Российской Федерации по рождению, в день обращения (пункт 45.3 Положения) .
21.2. Для исполнения государственной функции необходимо обращение заявителя в структурное подразделение территориального органа по месту жительства, месту жительства или рождения ребенка, месту нахождения ребенка в соответствующем учреждении, а при отсутствии места жительства - по месту фактического проживания заявителя (ребенка) .
21.3. Заявитель представляет документы, удостоверяющие личность и гражданство обоих родителей (единственного родителя) , и свидетельство о рождении ребенка. Наличие единственного родителя либо признание второго родителя безвестно отсутствующим или лицом, место нахождения которого неизвестно, подтверждается документами, указанными в подпункте 45.6 Положения.
21.4. Основаниями для отказа в исполнении данной функции являются отсутствие у ребенка гражданства Российской Федерации по рождению или непредставление необходимых документов.
...
21.8. Отметка, подтверждающая наличие у ребенка гражданства Российской Федерации, проставляется должностным лицом в верхней левой четверти оборотной стороны свидетельства о рождении ребенка

Так что изучайте Адм. регламент - и вперед, добивайтесь его выполнения сотрудниками ФМС.
====
Еще раз подытожу -
- отметку о гражданстве должны сделать в день обращения (если нет оснований для отказа)
- оба паспорта, подтверждающие гражданство РФ обоих родителей на день рождения ребенка, принести может один из родителей.