Два месяца назад взяли щенка, сейчас еще 3 месяца, живет в вольере, и есть взрослый пес.

Раз старый кобель недостаточно воспитан, то элементарно заходить к нему, когда мелкий сидит в своем вольере. И выпускать мелкого, когда старший заперт.

держите раздельно. неужели тяжело соблюдать элементарные правила

Хотел бы загрызть - давно бы загрыз уже. Животные понимают, кто маленький-большой. Мелкий играется просто, и ему просто интересен большой собак. А взрослый - понимает, то что мелкий - это мелкий, и его трогать нельзя, только иногда ему показывает свое недовольство.

Скалится? Это нормально. Если бы кобель был неадекватен, он бы уже давно загрыз или покалечил щенка. А если просто скалится и рычит, или слегка прикусывает - он просто так показывает "личные границы", воспитывает щенка, чтобы тот не приставал. Щенку это очень полезно, это учит его выстраивать отношения с другими взрослыми собаками. Если старший пёс не наносит ему повреждений, я бы не стал препятствовать их общению. Наоборот, пусть учится. Вы главное щенка самого дрессируйте, чтобы он не закончил так же, как старший пёс - на цепи без возможности гулять, заниматься с хозяином, играть...

Вы хотите тех же проблем, что и с взрослым псом только с щенком в будущем? Опять держите в вольере! Зачем? Собака должна общаться с хозяином. А для сторожевых псов, нужен характер сторожа минимум.

Держите их отдельно, иногда выводите мелкого на поводке к старшему, пусть знакомятся, потом привыкнут.