Котёнок умирает, что делать?

Отвести к ветеринару.

кормить его самой

Кошка перспективная? Имеет шикарные крови? Нет? Тогда нафига ей рожать потенциальных смертников? Надо кастрировать кошку после того, как откормит оставшихся в живых котят.

Согреть на грелке-бутыке теплой и к ветеринару... или помочь ему уйти если состояние тяжелое.

Зачем в отдельную коробку? Его надо на грелку или на кошку. Если кошка сама от него отказалась, значит не жилец.

И почему вы сегодня не вызвали ветеринара на дом да еще и котенка, у которого еще плохая терморегуляция, переложили в отдельную коробку, чтобы помер побыстрее?
Скорее всего он уже не жилец. Ветеринара вызывайте, ибо нужно искать причину: либо генетическое заболевание, либо при родах что-то пошло не так, либок инфекционное. Нужно обследовать всех котят и кошку, и срочно.
Цель вязки? Кошка самовыгулная? Привита? Обработа от глистов и блох? Чем кормите кошку?

Скорее всего, внутриутробная инфекция.
Котенка как можно быстрее к врачу, если еще успеете. И кастрируйте уже наконец кошку, как только закончит кормить, зачем плодите потенциальных смертников, если кошка у вас не обследована и не состоит в клубе?..
Хозяев не хватает даже на тех животных, которые уже есть, зачем плодить новых...

У него может быть плоскогрудие (ген. отклонение) либо волчья пасть

Пххахаха. К ветврачу и в переноске вези. Заболел скорее всего или подхватил инфекцию. Не выздоровеет - лучше отведи на эвтаназию или как-нибудь быстро и без мучений убей его, ибо какой смысл ждать смерти котенка, если он мучается. Но всё же убивать лучше только в крайних случаях. Надеюсь выживет

БОЖЕ ЧЁ ТУТ ВСЕ ТАКИЕ СТРАННЫЕ? ВЕТЕРИНАР - СОСКА - ОБОГРЕВ КОТА! БЫСТРЕЕ ПОКА ОН ЖИВОЙ!