Вопрос - материалистам: материя появилась из атомов- они из протонов и нейтронов, и т. далее - вот они-то откуда...

Материя, которую мы можем потрогать руками (ложка, чашка, автомобиль и т. далее.. ) состоит из атомов, которые состоят из ещё более мелких частиц (протонов, электронов, нейтронов и т. далее..) .
Но кроме этой материи, которую называют веществом, есть ещё совершенно особая непонятная материя, которую наш глаз воспринимает в виде света. Световая материя способна соединять электрон с протоном, образуя атом. Световая материя умеет соединять атомы между собой таким причудливым образом, что из этих атомов в итоге получается человеческий мозг, с помощью которого человек пытается понять ту самую материю, которая его породила.

Фраза "материя появилась из атомов" - бессмысленна.

Атомы - тоже материя.

Из энергии.

Первоматерия говорят была...

В вопросе кроется неточность. Согласнос современной физикой существует материя ( в т. ч. атомы, нейтроны-протоны и пр. ) и энергия (тепло, свет, флюорограмма ;-)), которые обладают свойствами взаимоперехода.. . (для понимающих)

Из космической пыли.

По идее это энергия которая создает силы взаимодействия

Из кварков

В ответ на высказывание ИлиЯ

Тепло - это колебания атомов.

Свет - это движение фотонов.

Флюорограмма - это снимок, основанный на поглощении фотонов атомами.

"Энергия" - это не материя, а математическое число, характеризующее интенсивность движения материи.

"Энергия" как и "Скорость" не мугут существовать без конкретного материального объекта.

Взаимопереход совершает материя, преобразуясь, например, из фотона в электрон или обратно.

Но кто объяснит, что происходит внутри фотона, когда он преобразуется электрон?

Материя не появилась из атомов, она СОСТОИТ из атомов! Если эта смысловая ошибка не допущена преднамерено, вопрос в том, можно ли делить материю бесконечно? Ответ нет. Квантуется все. Даже время.
Если же ты действительно не видишь разницы между "состоит" и "появилась", просто убейся об стенку и никогда больше здесь не пиши.