Апостолы писали книги против других христианских групп и течений?

Да писали.
6 Удивляюсь, что вы от призвавшего вас благодатью Христовою так скоро переходите к иному благовествованию,
7 которое [впрочем] не иное, а только есть люди, смущающие вас и желающие превратить благовествование Христово.
8 Но если бы даже мы или Ангел с неба стал благовествовать вам не то, что мы благовествовали вам, да будет анафема.
9 Как прежде мы сказали, [так] и теперь еще говорю: кто благовествует вам не то, что вы приняли, да будет анафема.
10 У людей ли я ныне ищу благоволения, или у Бога? людям ли угождать стараюсь? Если бы я и поныне угождал людям, то не был бы рабом Христовым.
(Гал. 1:6-10)

апостолы призывали к покаянию всех. а еретиков и раскольников обличали, например николаитов.

А непотребного пустословия удаляйся; ибо они еще более будут преуспевать в нечестии, и слово их, как рак, будет распространяться. Таковы Именей и Филит, которые отступили от истины, говоря, что воскресение уже было, и разрушают в некоторых веру.
2 Тим 2:16-18

отдельных книг не писал, но упоминал в письмах. видимо, секты начали появляться еще при жизни Павла, одна из них была основана Именеем и Филитом. также была секта николаитов, против которой выступал Павел: "Так и у тебя есть держащиеся учения Николаитов, которое Я ненавижу. "

апостолы писали для всех, без различия вероисповеданий и их течений, ..для всех я сделался всем, чтобы хоть кого нибудь спасти ап. Павел.