Из-за специфики и разнообразия изучаемых объектов палеонтология использует множество различных методов. На начальном этапе развития исследования в палеонтологии в основном были направлены на выяснение и описание разнообразия органического мира прошлого, создание систематик и выяснение филогенетических взаимоотношений ископаемых групп. Позднее чётко обозначились вполне самостоятельные направления:
1) таксономическое (разнообразие, систематика, региональные фауны и флоры) ;
2) морфофункциональное и эволюционно-морфологическое;
3) филогенетическое;
4) палеоэкологическое;
5) микроструктурно-гистологическое;
6) палеобиогеохимическое;
7) палеобиогеографическое;
8) биостратиграфическое и др.
Наконец, в самое последнее время обособились палеонтология докембрия, молекулярная палеонтология, бактериальная палеонтология, биосферное направление и изучение необычных (экстраординарных) биот. Такая дифференциация палеонтологических исследований определяется по крайней мере двумя причинами. Во-первых, задачи палеонтологии значительно обогащаются её кооперацией с другими областями биологических и геологических наук, а во-вторых, расширяются с развитием методической базы (внедрением электронной микроскопии, томографии, микроанализаторов, компьютерной техники) .
Обособление новых направлений не означает, однако, что результаты традиционных исследований утрачивают своё значение. Традиционные описания новых таксонов и региональных фаун и флор всегда были и будут оставаться фундаментом палеонтологии, поскольку без пополнения именно этих данных все остальные исследования могут быстро потерять смысл, лишившись основы. Остановимся на самых ярких достижениях последних лет, как в традиционных, так и в новых направлениях
http://evolution.powernet.ru/library/modern_paleontology.html
Как правило, останки растений и животных разлагаются и исчезают без следа. .
о степени убедительности палеонтологических доказательств эволюции, ..
их нельзя будет использовать для идентификации конкретного слоя.
подробно http://evolbiol.ru/evidence03.htm
