Есть ли мысли в отрубленной голове? Например на гильотине? Осознает она, что ее отрубили и если да, то как долго?

При падении кровяного давления мозг теряет сознание. Да, формально он ещё жив, до наступления клинической смерти, но он себя не осознаёт.
В кошерном забое скота очень важно, чтобы животное не мучалось. Поэтому (цитирую "Вики", https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A8%D1%85%D0%B8%D1%82%D0%B0 ):
"Забой выполняется рассечением трахеи, пищевода, общей сонной артерии, яремной вены и блуждающего нерва одним быстрым движением очень острого клинка (халеф), которым действует высококвалифицированный шохет. В результате в мозгу жертвы мгновенно падает кровяное давление и происходит необратимая потеря сознания."
При отсечении человеческой головы происходит то же самое. Главная тут - сонная артерия, по которой кровь попадает в мозг. Она не случайно так названа - если её пережать (не разрушая), человек теряет сознание. Потом, если воздействие короткое и кровь продолжит поступать, человек "просыпается" - но какое-то время после пережатия сонной артерии он "спал".

Пока сие неизвестно... даже отряд 731 не сумел вычислить - осознает ли что то отрубленная голова

При отрубании головы перерубается спинной мозг управляющий всеми функциями организма.... Если перерубить кабель, будет что-то работать? Ваш компьютер например, если у него нет аккумулятора? Да, он вполне исправен и в отличие от биологических систем не начинает сразу разлагаться, но работать он не будет.

Вроде да, несколько секунд она ещё в сознание.

Осознаёт, ибо клиническая смерть наступает через 1 минуту примерно, а биологическая смерть минут через 5. Есть книга, в которой приводится много подобных случаев. В немецком княжестве в Средневековье несколько рыцарей восстали против курфюрста. Были приговорены к казни . Главарь сказал,что если он пробежит после отрубления головы мимо остальных приговоренных, то их помилуют. Курфюрст согласился. Тому рыцарю отрубили голову и он успел пробежать мимо 10 других приговорённых.

Конечно, в средние века отрубленные головы корчились от боли и грызли корзины в которые падали

Да. Вот видео про эту тему

https://www.youtube.com/watch?v=wwvs9Ug4L8A

Этим вопросом задавались ещё в XVIII веке. Считалось, что человек, казнённый на гильотине, не умирает мгновенно, а его голова, после того, как слетает с плеч, ещё продолжает несколько секунд слышать и видеть, что творится вокруг. Именно поэтому французские революционеры вытаскивали отсечённую голову из корзины и демонстрировали её рукоплескающей толпе, чтобы казнённый успел увидеть, как народ радуется его смерти. Ходил даже слух о том, что некоторые головы в последний момент вращали глазами, корчили гримасы и матерились. Но это, скорее всего, легенда.
Как человек, который жил в деревне и собственноручно, одним взмахом топора, осекал петухам голову, могу сказать, что гримасы на лицах объясняются спазмами мышц, приводящих в движение губы и глаза. После отрубания головы человек ещё живёт пару секунд, но в этот последний момент он уже совершенно не понимает, что с ним происходит. Мысли отрубленную голову точно не посещают.