папки на флешке переименовались в exe и стали как приложение. как из этих папок вытащить нужные файлы?

Из этих файлов Вы не вытащите папки, т. к. их там нет. Это действие вируса. Он создал файлы с расширением exe чтобы вы думали, что это папка (т. к. на нем еще и значок папки) . И открывали ее. А на самом деле это вирус. Поэтому действия такие:
1. Прогоните компьютер антивирусником. Удалите вирусы. После этого зайдите в любую папку. Там выберите меню Сервис-Свойства папки. Перейдите на вкладку Вид. Уберите галочку Скрывать защищенные системные файлы и поставьте опцию. Показывать скрытые файлы и папки. Ваши папки отобразятся. Просто они скрыты. После этих действий Вы их увидите. Щелкните на каждой из них правой кнопкой, выберите Свойства и уберите галочку Скрытый и Системный если она там будет. Ваши папки приобретут нормальный вид

в свойствах папки сотри ехе

переименуйте в .rar и извлеките winrar ом

В дополнение к ответу от Вадим Кульпинов
Если машина сильно завирусована (что вполне вероятно) , изменение настроек вида не поможет - скрытые и системные файлы могут в проводнике не отображаться.. .
Можешь воспользоваться проверенным способом - любым файловым менеджером:
far
или
total commander
в любом из них увидишь "имя_папки" (с атрибутом "скрытый") и "имя_папки. exe" - вирус.
-------
на счет лечения:
1) drweb - CureIT!
Если компьютер вообще без антивируса (или какой-нить есть, но со старыми базами) , то скорее всего не поможет - только пункт 2 или 3
2) drweb.LiveCD
3) Kaspersky.LiveCD
Любой из трех качается с сайта разработчика "савэршенна бэзплатна! "

товарищи, дополнительный вопрос по теме, а если в свойствах папки, галка на "Скрытый" не активна, какой порядок действий чтобы сделать папку не скрытой?