Может ли установка бесплатного софта аннулировать гарантию ноутбука?

Это не пугание, а РЕАЛЬНОЕ требование и условие.

бесплатный же, как это может быть связано с нелицушным?

пусть пугают, гарантия на железо дается, через суд сможешь всегда доказать свою правоту, хоть винду сноси

у нас в саратове ремонтирует без разницы с каким софтом. Даже с пиратской ос ремонтируют

Могу вам точно сказать.

Гарантийный срок "аннулировать" нельзя. Продавец несет ответственность за недостатки в любом случае в течение всего гарантийного срока, если не докажет вашу вину в возникновении недостатка. А даже если и докажет (обосновав причинно следственную связь) по какому-то недостатку вашу вину, то по этому не отвечает, но продолжает отвечать за другие недостатки производственного характера, которые могут возникнуть в товаре в течение оставшегося гарантийного срока.

Разумеется, если левое ПО не является причиной возникновения недостатка, то продавец обязан удовлетворить ваше требование. Не его дело, какие программы вы ставите на своей собственности.
Все написанное также применимо к нарушению пломб, вскрытию, модификации товара, т. е. причинно следственная связь должна быть между этими действиями и недостатком. Иначе любой продавец из-за царапины на корпусе сразу же отказывал бы.

Что касается т. н. правил, о которых пишет Вадим - так это полнейшая брехня в силу ст. 16 ЗоЗПП.

Гарантия распространяется только на "Железо" , то есть на физическое устройство-ноутбук. Материнка, жёсткий диск, оперативная память и т. д.

значит да раз в магазе говорят

Нет. Причем здесь бесплатный софт.

Эм, смотря какой софт. Если он действительно бесплатный, то нет. Если это пиратский софт, то в мелких программах как игры или антивирус нет, а вот если вы снесете базовую Win7Starter и поставите допустим XP пиратку, то гарантия слетит. т. к. например если вы решите после его поломки не чинить его, а сдать в магазин, то они его банально не продадут.