какой формат лучше avi или mkv. чем руководствоваться при выборе

А причем тут текст?
Это контейнеры для видео.
Матроска новее, но не всеми проигрывателями поддерживается.

Смотря для чего. .
MKV, в принципе, позволяет гораздо больше, чем AVI контейнер

Возможности формата, закладываемые в Matroska:

трансляция через Интернет (протоколы HTTP и RTP);
быстрая перемотка по файлу;
устойчивость к ошибкам;
экранные меню (как на DVD-дисках) ;
разбиение файла на главы (Chapters);
переключаемые «на лету» субтитры;
переключаемые звуковые дорожки;
переключаемые видео дорожки;
модульная расширяемость.

Кстати, почитайте сравнение AVI, OGM, MKV в деталях (правда на английском и немного устаревшее. . мой ТВ играет mkv без проблем - скачал Аватар 3D на 19.5 гигабайт в формате .mkv и отлично посмотрел) )
http://www.alexander-noe.com/video/documentation/containers.pdf

avi. воспроизводится на большинстве видеоустройств, с mkv. могут возникнуть трудности (многие его не поддерживают).

avi потом проще куда-либо залить, майл. ру допустим mkv не хавает и ютуб тоже, только avi, flv и mp4 и всё. в mkv только кинишко дома 20-40 гигабайтное хорошего качества посмотреть к примеру можно и всё...

мкв лучше. руководствуйтесь железом. на слабых видеокартах часто проблемы с мкв

АВИ нормального качества и "весит" средне. МКВ суперкачества, но и "весит" в три раза больше. Если места на диске мало или надо фильм вместить на болванку ДВД - то выбирайте АВИ. Если места достаточно - выбирайте МКВ.

Лично я использую. avi и тебе советую.