Каким образом происходит подгрузка в 1С документов и возможно ли это вообще? Версию 1С точную не знаю

К сожалению вы не написали о каком именно электронном документообороте речь, с налоговой или с контрагентами, было бы на много проще.

Если речь о взаимодействии с ФНС, то да, такая возможность в 1С есть, для этого необходимо активировать встроенный в программы 1С штатный сервис "1С-Отчетность" и вы сможете обмениваться информацией с налоговой службой прямо из программы 1С, без использования программ-посредников, без выгрузок/загрузок данных и т. д.
Т. е. использование сервиса 1С-Отчетность дает возможность вести учет и сдавать отчетность из одной единой программы:
- Новая форма декларации по НДС, включающая сведения из книг покупок и продаж и журнала учета счет-фактур, формируется автоматически по данным из информационной базы программы 1С (в полном соответствии с изменениями по НДС в 2015 г.)
- Для исключения ошибок в реквизитах контрагентов прямо в программах автоматически проводится их проверка на сервере ФНС (как в оперативном и фоновом режимах, так и непосредственно перед формированием декларации по НДС.)
- Отправка декларации в ФНС производится "в один клик" прямо из программы 1С, без выгрузок/загрузок в другие приложения.
- Запросы на уточнение из ФНС попадают прямо в программу 1С, без необходимости загрузки из других программ.
- Уведомление пользователя о каждом поступившем запросе ФНС и подтверждение получения запроса происходит автоматически.
- Средствами программы 1С можно будет быстро перейти в ту строку декларации, по которой требуются пояснения.
- Средствами программы 1С можно провести анализ ситуации, внести уточнения в налоговые и первичные документы.
- Уточняющие сведения для ФНС сформируются автоматически, и их можно будет отправить прямо из программы 1С.

Подробнее о подключении 1С-Отчетности здесь
online-ufa.ru/products/otchetnost.php

Если же речь о сверке счетов-фактур с вашими контрагентами (поставщиками/покупателями), то это тоже есть в 1С, подробнее здесь.
http://buh.ru/articles/documents/40969/

Группа компаний "Онлайн", г. Уфа
Автоматизация предприятий на базе программ 1С с 1995 г.
online-ufa.ru
vk.com/online_ufa

Как замечательно, что в Моем деле есть тех. поддержка для всех клиентов, где можно получить оперативный ответ и не надо на стороне искать решение вопроса