Цель посетить европейские страны желательно Чехию, Францию, Германию С минимум затрат

без затрат можно путешевствовать не возможно

1. По переездам. Самостоятельно Вы считаете отправление с юга, а тур из Москвы. Если поискать отправление из Москвы в случае самостоятельного путешествия, то можно найти много скидочных тарифов (лучше самолетных, кстати, а не на поезде, поезда в Европу - дорого) , а если ехать как в туре поездом из Москвы до Бреста, а потом автобусами, то еще дешевле.
2. Перемешение внутри стран шенгена на поездах - самое дорогое, машина актуальна, если вас несколько человек, самое дешевое -опять же пресловутые автобусы. При бронировании заранее -определенные скидки.
3. Вы забыли посчитать экскурсии в туре, ведь там в стоимость входят только обзорки, где Вас провезут по городу 30 минут, а все посещения достопримечательностей и входные билеты за отдельную плату.
4. По жилью - 900 рублей с одного в Праге - это дорого, можно найти дешевле. При желании можно и в Германии найти достаточно дешевое жилье.
5. Чиптрип - это не оператор, это просто фирма, которая скидывает горящие туры разных операторов. В данном случае может быть тур от какого-нибудь приличного, либо же от туроператора, от которого все плюются, тогда с организацией, гидами и отелями будет полная ж.. . То есть - поселят на окраине города, куда не ходит общественный транспорт, неадекватное поведение сопровождающего гида и т. д.
6. Честно говоря, мало времени, скаканье сплошное. Я ездила на 12 дней - это уже куда ни шло, а здесь из 8 дней почти 3 дня в дороге туда-обратно.
7. Про попутчиков. От Москвы и обратно будут одни и те же люди всегда, за каждым закреплено место в автобусе, в гостинице расселяют всегда с одним и тем же человеком на протяжении всего маршрута.
8. Курить в Европе на улице можно, все курят, только не делайте этого в общественных местах типа кафе, метро и прочего.
9. Про одежду: маек больше, учитывая ночные переезды. Если будет жара, то в одной и той же майке ходить - портить настроение окружающим в автобусе людям. Ветровку обязательно, в прошлом году была в середине июля - с ветровкой практически не расставалась, температура была 18-20, а вечером и того холоднее. В Берлине и Амстердаме вообще был постоянно дождь, так что еще и зонтик. Обувь УДОБНУЮ. Лучше раздолбанные кроссовки, и лучше 2 пары на всякий случай. Ходить придется много, а выпендриваться ни перед кем не стоит, так как в Европе на одежде не заморачиваются.
Если едете в первый раз, то лучше туром, но я бы выбрала туроператора, о котором что-то известно, но самостоятельно лучше и интереснее, с подсчетами у Вас не очень правильно получается. Если хотите поехать без турфирм - идите на форум Винского (находится сразу любым поисковиком в инете).

Топай на forum.awd.ru - форум самостоятельных. Там тебе обстоятельно ответят или сам найдёшь ответ. Если не ходишь по ссылкам, то набери в поисковике "форум Винского".

Вы не учли затраты на оформление визы и медстраховки, которая в Шенгене обязательна.
А что касается группового тура, то народ там на всем маршруте один и тот же. От начала и до конца.