Рассинхронизация видео и аудио в MOV файле

конвекторы:
-ImTOO HD Video Converter v 5.1.26.1012
-ImTOO Video Converter Ultimate 6.5
-Xilisoft Video Converter Ultimate 6
и не каких проблем

Попробуйте ужать ужать видео (уже переведенное Вами из MOV в AVI и смонтированное) в окончательный формат - например, кодеком DivX или XviD.
У меня такое бывало, что с воспроизведением малосжатого видео комп, даже достаточно сильный, не справлялся - у меня такое впечатление, что причина бывала не в недостаточной производительности процессора, а в недостаточной пропускной способности шины передачи данных (декодировка малосжатого видео - задача предельно лёгкая, но поток исходных данных в этом случае велик) .
К сожалению, VirtualDUB, насколько я знаю, не работает с видео высокого разрешения (или я уже отстал от жизни?) . Ужимать кодеком можете в любой видеомонтажной программе, поддерживающей работу с таким видео, если монтажа как такового нет - конечный результат от того, какую программу Вы выбрали, зависеть не должен.

Начинаете с того, что смотрите после КАКОЙ операции начинается рассинхрон. Предположительно, он будет после склейки AVI-шек. Дело в том, что они КРАЙНЕ критичны к ДЛИНЕ видео и аудио потоков. Когда их воспроизводят порознь, синхрон держит плеер, даже если есть небольшая разница, но коль произведена склейка, то СДВИГ звуковой дорожки будет заметен (произойдёт склейка 1 части звука со 2 без правки длины, что недопустимо) .
Итак, прежде чем клеить AVI-шки, положено осуществить подгон длины звука и видео в КАЖДОМ фрагменте.

Так кодируешь. Virtual Dub это сделает без перекодировки.

Монтаж-склейку делайте в пиннакле. и всё будет окей. Интерлейф звука ставьте на ноль.

Если рассинхрон происходит после склейки, то более правильно загружать видео в программу видеомонтажа, типа Pinacle, монтировать и сохранять в avi.