Почему мыы летаем На самолете, ездим На поезде, плывем На катере ,когда можно войти В самолет В поезд , итд?

На крыше самолета а не в самолете

ну давай разбираться тогда. Первое - ездят В поезде, а не НА поезде. Второе предлог НА означает подъем, если ты вспомнишь то на самолет подымаются путем вхождения в него. Если есть крыша и подьем то употребляются два предлога НА и В. Если крыши нет то только НА

А что лететь можно только на крыше?

А ...понял вашу фишку, не сразу врубился....)))