Вся существующая материя, какой ее понимает человек - это таблица Менделеева ?

Думаю до этого Менделеева человек уже существовал.
И "таблица" была еще до Менделеева.

Это не все. Как же темная энергия, бозон Хиггса?

В общем--ДА (включая неоткрытые элементы)

Нет конечно. Поля (электрическое, магнитное, гравитационное, футбольное 🙂 -- это тоже особые виды материи.

На самом глубоком уровне, вся материя - это желание получать.

В философии нет более мутного и противоречивого понятия, чем "материя".
Это обстоятельство почему-то всегда крайне раздражает материалистов.

Это на современном этапе науки.

В пределах познанного, пожалуй, - да. Но мы ещё многого не знаем.

Есть ещё много не открытого, например тёмная энергия в космосе (чернота)