Есть ли в игре FarCry 3 возможность продолжить игру после ее прохождения в режиме Freeplay?

Конечно же есть. Доигрывай, не бойся.

да, когда игру проходишь дальше просто бегаешь по острову

Да. После концовки будет табличка- Сюжет завершен, теперь вы можете играть в свободном мире.