есть ли документированные потомки древних династий (например, Ахеменидов, фараонских династий, в настоящее время?

Возможно.
Но врядли-Посмотрите историю Романовых.
Их перевели с правящих ролей менее чем 100лет назад. А уже такая путаница между
ними. А тысячи лет сколько всего перемешалось? А?