Скажите, как правильно говорить hundred kilos of apples или one hundred kilos of apples? Или и так и так правильно?

hundred - это дословно не сто, а сотня.
Соответственно, перед именем существительным должно стоять либо a/an артикль (в данном случае а) , либо другой определитель one, например.
Т. е. :
a hundred kilos of apples
one hundred kilos of apples
Эти два варианта верны.