6Д, причем без вариантов. Между ними 4 года развития технологий - это целая вечность для цифровой фотографии.
5Дмк2 отличается весьма туповатой автофокусировкой, в то время как 6Д имеет отличный АФ, причем центральная точка может ловить фокус чуть ли не при лунном свете, заявлено до -3EV (у топовых Никонов Д4 и Д800 лишь -2EV для сведения) . Видео здорово продвинулось вперед. Используется современная матрица, обладающая гораздо более низким уровнем шумов, чем 5Дмк2. Наличие GPS и Wi-Fi модулей тоже для многих будет приятным бонусом.
Короче, долго перечислять, но 5Дмк2 - это уже реликтовая хреновина, которую покупать можно с рук в случае когда не хватает денег на современную камеру. Если есть деньги на 6Д, то в сторону мк2 даже смотреть смысла нет.