какие начисления необходимо сделать если сотрудник не пошел в очередной отпуск

если сотрудник работает, значит ему в обычном порядке начисляется зарплата и всё, больше ни каких дополнительных начислений не производится.
заменять отпуск денежной компенсацией нельзя, это ТК РФ не предусмотрено.