После окончания колледжа (на базе 9 классов) можно поступить в ВУЗ только по профилю? Или можно поступать в любой ВУЗ?

Можно в любой. Но Вы должны иметь сертификат ЕГЭ по трем экзаменам, которые требуются для той, специальности, на которую будете поступать