недорого либо в хостеле где в комнате будет как минимум несколько человек, либо снимать комнату в квартире.
Вот посмотрите вариант http://www.sretenkahotel.ru/ Останавливались там, когда были в Москве в командировке, но там не только командировочные живут, вообще хорошая атмосфера и персонал замечательный.
Пенсионат.
можно снять от койко-места до квартиры : на Казанском ж\д вокзале в зале повышенной комфортности ОФИЦИАЛЬНО на стойке ресепшен предлагают.
1-местные в Москве от 1100, с удобствами от 1600. Место в 10-местном хостеле от 400. Места всегда есть. И обычно при крупных клиниках есть свои гостиницы, но маловероятно, что цены будут ниже, хотя можно узнать заранее.
Рекомендую хостел Иван ( http://ostrovok.ru/hotel/russia/moscow/id155485/ivan_hostel/ )