расскажите почему у организаций арестовывают счет. с чем это связано и будет ли она продолжать работать

Так нужно в банке запросить решение или напрямую в ИФНС. Скорее всего за не предоставление отчетности, деклараций или есть задолженность по налогам -вспомните может требование было а вы не уплатили.

Работать будет когда все претензии будут сняты.