Какой примерно процент уголовных дел в России заканчивается извинениями прокурора и правом на реабилитацию?

не знаю, как сейчас, но по состоянию на 2012 год - 2-3%
Не думаю, что за это время произошли радикальные изменения.

5%, прокурор не извиняется!

небольшой... и это не целые числа... а после запятой....